La misión de la Dirección de Investigación consiste en realizar indagaciones académicas que contribuyan a la aprehensión de los fenómenos sociales, económicos, políticos, culturales y de otra índole que se manifiestan en el entorno socia local y global. Su visión se enfoca en ser una Dirección de Investigación con una participación activa y crítica en el proceso de construcción del conocimiento en El Salvador.
Sus objetivos se enfocan en promover la generación de nuevos conocimientos básicos y aplicados, mediante el impulso de la investigación científica y el desarrollo tecnológico; consolidar la investigación en las ciencias sociales, las humanidades y las artes, con el fin de responder a las necesidades del desarrollo regional, nacional y global; impulsar la preparación teórico-metodológica y la actualización disciplinaria permanente del personal académico, para fortalecer e innovar el trabajo de investigación; generar enfoques y procesos de investigación inter y transdisciplinarios en todas las áreas del conocimiento ante los retos del desarrollo económico y social; hacer efectivos los procesos administrativos y de gestión de la investigación en la Universidad con el propósito de mejorar las condiciones materiales, de infraestructura y de organización, y difundir eficiente, oportuna y ampliamente los resultados de la investigación científica, tecnológica, humanística y artística de la Universidad Gerardo Barrios.
La Dirección de Investigación está comprometida con el desarrollo económico, social y cultural de El Salvador, el departamento de San Miguel y la Zona Oriental. Reconoce la diversidad socio-natural de su entorno y el compromiso de su quehacer académico para aportar respuestas viables a las necesidades y problemas de la comunidad.
Con el propósito de cumplir los fines mencionados, define líneas prioritarias de investigación, que promueven de manera especial las investigaciones orientadas a solucionar problemas de la Zona Oriental y a nivel nacional para difundir y extender con la mayor amplitud posible los beneficios de la cultura.